交通运输工程领域专业硕士学位点于2014年获批、2018年整合，依托“城市道路交通智能控制技术”北京市重点实验室、“首都顺畅交通协同创新中心”开展人才培养工作，下设道路交通运输和轨道交通运输两个招生专业。
道路交通运输专业设有综合交通信息感知技术与决策、交通控制理论与技术、载运工具与智能驾驶、交通运输规划与管理、交通安全理论与技术五个培养方向。培养能够将电子技术、信息技术、控制理论、计算机及网络技术等应用于交通控制与管理，具有独立承担交通运输系统分析、研究、开发、系统集成、建模、仿真、优化等太阳集团或技术性工作的能力，具备工程项目的组织与管理能力、团队协作能力。
轨道交通运输设有轨道车辆牵引控制与检测技术、轨道交通智能监控及诊断、轨道交通运输组织优化三个培养方向。能够将电力电子技术、信息技术、控制理论、计算机及网络技术等应用于轨道车辆牵引控制与检测、智能监控及诊断以及轨道交通组织优化等领域，具有独立承担轨道交通运输系统分析、研究、开发、系统集成、建模、仿真、优化等太阳集团或技术性工作的能力，具备工程项目的组织与管理能力、团队协作能力。
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